Dubbel genomsekvensering vid leukemi: Analys av cancerceller och germlinje

Hoppa till avsnitt

• Varför sekvensera både cancerceller och normala celler
• Substrat för cancercellsekvensering
• Den ökande betydelsen av germlinjesekvensering
• Hur germlinjesekvensering utförs
• Kliniska implikationer av ärftliga cancerfynd
• Precisionsmedicin i praktiken

Varför sekvensera både cancerceller och normala celler

Genomsekvensering, inklusive nästa generations sekvensering (NGS) och hel-exomsekvensering (WES), är numera en standardmetod inom onkologin. Dr. Shai Izraeli, MD, betonar att sekvensering måste utföras på två olika celltyper: cancervävnad från en biopsi och patientens normala celler. Denna dubbla metod är grundläggande för modern precisionsmedicin, eftersom en betydande andel cancerformer har ärftliga komponenter. Information från båda sekvenseringarna är avgörande för att skräddarsy effektiv behandling och bedöma cancerrisk i patientens närmaste familj.

Substrat för cancercellsekvensering

För leukemipatienter utgörs substratet för cancergenomsekvensering vanligtvis av celler från en benmärgsbiopsi eller perifert blod. Som Dr. Shai Izraeli, MD, förklarar är det avgörande att sekvensera de leukemiska cellerna för att identifiera drivande genetiska mutationer, såsom BCR-ABL-abnormaliteten vid Philadelphia-kromosompositiv leukemi. Dessa förvärvade mutationer är cancerspecifika och utgör primära mål för precisionsbehandling. Anrikning av provet med cancerceller är ett nödvändigt steg för att säkerställa att NGS-data är korrekta och kliniskt användbara för diagnos och behandlingsval.

Den ökande betydelsen av germlinjesekvensering

Utöver tumörsekvensering blir germlinjesekvensering allt viktigare inom cancervården. Dr. Shai Izraeli, MD, pekar på växande bevis för att genetik spelar en stor roll både vid barn- och vuxencancer. Forskning indikerar att upp till 15 % av cancer hos barn har en ärftlig komponent. Denna insikt är djupt betydelsefull för behandlingsplanering, särskilt vid övervägande av benmärgstransplantation från en syskondonator som också kan bära samma cancerpredisponerande mutation. Germlinjesekvensering ger en heltäckande genetisk bild som är essentiell för patientens och familjens säkerhet.

Hur germlinjesekvensering utförs

Germlinjesekvensering analyserar en patients ärvda DNA, som bäst erhålls från icke-cancerösa celler. Vid blodcancer noterar Dr. Shai Izraeli, MD, att en vanlig källa är en hudbiopsi för att odla fibroblaster. Denna procedur integreras ofta sömlöst i vårdplanen för barn, som ofta genomgår anestesi vid insättning av en central venkateter för cellgiftsbehandling. Genom att ta en liten hudbiopsi under denna smärtfria procedur kan kliniker säkra ett rent prov av normalt DNA för germlinje-NGS-analys, vilket ger en bekväm upplevelse för den unga patienten.

Kliniska implikationer av ärftliga cancerfynd

Upptäckten av ett ärftligt cancersyndrom via germlinjesekvensering har omedelbara och långtgående kliniska konsekvenser. Som Dr. Shai Izraeli, MD, framhåller kan denna information direkt påverka behandlingsintensitet och val av stamcellsdonator, vilket förhindrar användning av en syskon som bär en högriskmutation. Dessutom möjliggör identifiering av en cancerpredisponerande mutation genetisk rådgivning och testning av nära familjemedlemmar. Detta proaktiva tillvägagångssätt underlättar tidig upptäckt och förebyggande strategier för släktingar i riskzonen, vilket i grunden kan förändra en hel familjs hälsotrajektor.

Precisionsmedicin i praktiken

Att sekvensera både cancerös och normal vävnad är en tydlig förkroppsligande av precisionsmedicin. Dr. Shai Izraeli, MD, beskriver detta dubbla tillvägagångssätt som ett kraftfullt verktyg som lett till anmärkningsvärda botanden, inklusive nyliga framgångar vid hans center. Genom att omfattande analysera hela den genetiska landskapet – både de förvärvade mutationerna i leukemiceller och de ärvda mutationerna i germlinje-DNA – kan onkologer erbjuda högt individanpassad och effektiv vård. Denna strategi säkerställer att behandlingen inte bara är riktad mot cancern, utan också säker och informerad av patientens fullständiga genetiska arv.

Fullständig transkript

Genomsekvensering (NGS, WES) av tumörer är numera vanligt. Men varför behöver man sekvensera både cancervävnad från biopsi eller tumörresektion och patientens normala celler (ofta från hudceller eller fibroblaster)? En betydande andel cancerformer är ärftliga. NGS-information kan vara avgörande för behandling och för andra i den närmaste familjen.

Dr. Anton Titov, MD: Ni utför genomisk nästa generations sekvensering (NGS) av barnleukemiceller. Vad används som substrat för sekvenseringen? Är det perifera blodceller eller benmärgsbiopsi?

Dr. Shai Izraeli, MD: Detta är en komplicerad fråga som jag delar upp i två delar. Jag gav dig ett exempel med Philadelphia-liknande eller Philadelphia-leukemier med BCR-ABL-abnormaliteter. Dessa genetiska mutationer (kromosomomläggningar) finns i leukemiceller. Det är mycket viktigt att sekvensera cancercellerna själva.

Dr. Anton Titov, MD: Måste man anrika celler för nästa generations sekvensering (NGS) av cancer?

Dr. Shai Izraeli, MD: Ja. Jag kan senare ge ett fantastiskt exempel på en barncancerbot som vi nyligen uppnådde på vårt center. Den boten visar också vikten av tumörgensekvensering.

Något annat blir också allt viktigare. Vi lär oss att genetik är allt betydelsefullare för tumörer i barndomen och vid vuxencancer.

Vi tror att upp till 15 % av cancer hos barn har en ärftlig komponent. Detta är viktigt! Eftersom man kan behöva ge en cancerpatient benmärgstransplantation från en bror eller syster. Men de kan också bära en cancerpredisponerande mutation.

Alltmer sekvenserar vi nu också germlinjen. Germlinjen avser inte leukemicellerna själva. Vid blodcancer sekvenserar vi ofta celler från huden. Vi sekvenserar hudceller från en fibroblastodling.

Det är mycket vanligt att ta hudbiopsier från barn. Eftersom vi sätter centrala venkatetrar för cancerbehandling hos barn under anestesi. Vi strävar efter ett smärtfritt sjukhus; allt görs under anestesi. Då tar vi också en hudbiopsi.

Alltmer utför vi germlinjesekvensering från hud. Vi upptäcker ärftliga cancerformer i familjer. Vi sekvenserar båda vävnadstyperna. Vi gör sekvensering av cancerleukemiceller från benmärg och sekvenserar också normala celler från germlinjen, som vanligtvis kommer från hudfibroblaster.

Dr. Anton Titov, MD: Detta är verkliga exempel på precisionsmedicin! Ja.